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EB病毒的检测通常使用荧光定量PCR，血清或血浆操作简单但敏感度低，而全血或外周血更敏感。EB病毒主要侵犯B淋巴细胞，病情加重时病毒DNA在血浆中升高，增加检测可能性。外周血中免疫细胞的聚集使得检测更早反映感染情况。