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真菌性咽喉炎由局部菌群失调引起，常见于免疫力低下的患者，如艾滋病患者和长期卧床的老年人。长期使用抗生素或含华素片也可导致此病。治疗上应提高免疫力和恢复菌群，可使用全身抗真菌药物及碳酸氢钠漱口水减轻症状。