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隔离肺手术的风险主要在于血管的处理，因其供血离主动脉很近，压力高。处理时必须小心离断，防止破裂，一旦出现出血情况需立刻转为开胸手术。该情况在千例中约出现1/1000到2/1000的概率，需增强风险意识。