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大多数先天性心脏病患儿不合并其它畸形，常见如房间隔缺损和室间隔缺损，治疗后可恢复正常。部分先天性心脏病如21三体综合征和威廉姆斯综合征可合并其它畸形，后者可导致智力发育迟缓。复杂性先天性心脏病多见于Cantrell五联征等。