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纵隔肿瘤根据纵隔的分区可以分为前、中、后纵隔，并进一步分类为良性和恶性肿瘤。良性肿瘤常见于前上纵隔的胸腺瘤，恶性肿瘤则在中纵隔多见淋巴瘤，后纵隔最常见的为神经鞘瘤。

胃肠道间质瘤通常表现为CD117和CD34阳性，而平滑肌瘤/肉瘤则表现为阴性。胃肠神经鞘瘤S-100弥漫性阳性，CD117和CD34为阴性。胃肠道自主神经瘤各项标志物表达均为阴性，且电镜下可见神经分泌颗粒。