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血管母细胞瘤手术风险因肿瘤位置、大小及周围组织关系而异。脑干或脊髓深处的肿瘤手术风险较高，而表面或易到达的肿瘤相对风险较低。较大肿瘤与正常组织交织，切除难度增加。术中可能出现出血、感染等并发症，需仔细操作与准备。部分患者可能更适合药物或放射治疗。