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对于没有贫血的轻度慢性再障患者可观察，无需治疗。生活质量受影响的患者可选用免疫抑制治疗，环孢素为首选。部分患者只需雄激素治疗，部分患者可通过新药治疗改善生活质量，避免高风险的骨髓移植。

再生障碍性贫血分为重型再障和普通性再障，其中重型再障表现为明显出血感染、乏力及严重贫血，并需根据特定血液指标进行诊断。慢性再障可能进展为重型再障，二者在治疗上有显著区别，重型再障需采用更风险和昂贵的治疗。