第二代试管婴儿又称为卵母细胞胞浆内单精子显微注射，它适用于丈夫严重少(数目少)弱(精子活动力低)畸形精子症，不可逆的梗阻性无精子症(如输精管结扎术后复通失败、先天性无输精管、输精管后天由于感染如感染结核导致堵塞等)，精子发生障碍(除外遗传所致)，精子顶体功能异常。这就说明了，第二代试管婴儿与第一代试管婴儿并不存在谁比较好的问题，而是针对的患者不同情况采取的两种方法。第二代试管婴儿的产生主要是为了解决男性不育症。