虽然试管婴儿是直接将胚胎转移到子宫中，这个过程绕开了输卵管，但来自未经治疗的输卵管积水的威胁仍然存在。积水可以流入子宫，这可能会在怀孕初期对子宫环境造成严重破坏。对于生育能力较差的患者，输卵管积水可将成功几率降低50％。如果女性在接受输卵管积水治疗后再做试管婴儿，怀孕成功率会更高。但是并不是有严重积水一定不能成功，而且成功率降低，可能积水没有倒流入子宫，故没有影响到胚胎着床。