用生长激素治疗矮小症是有一定的副作用的。有报告称可以引起患者甲功异常，主要是导致患者血清中的TSH降低，同时也引起T4降低。

所以患者在应用生长激素治疗矮小症的时候要定期复查甲状腺功能。如果患者在治疗之前就伴有甲状腺功能减退，或者是在治疗中出现甲状腺功能减退，影响生长激素促生长作用时，首先要给予甲状腺激素替代治疗。