回盲部肠系膜尚未完全固定，活动度大是容易发生肠套叠的结构因素。发生肠套叠的肠管多有明显的器质性原因，如梅克尔憩室翻入回肠腔内，成为肠套叠的起点。肠息肉、肠肿瘤、肠重复畸形、腹型紫癜致肠壁肿胀增厚等均可以牵引肠壁发生肠套叠。有些促发因素可导致肠蠕动节律发生紊乱，从而诱肠套叠，比如饮食改变、病毒感染及腹泻。

肠套叠是一种危及生命的急症，一旦确诊要立即治疗。发病48小时内，一般情况良好的可以灌肠复位治疗。发病超过48～72小时，怀疑有肠坏死或穿孔，小肠型肠套叠的要手术治疗。