毛囊炎要分为真菌感染所致与细菌感染所致。 真菌感染性毛囊炎：使用抗真菌药物，外用一般为酮康唑、益康唑、特比萘芬等，内服一般有伊曲康唑、氟康挫、特比萘芬等。 细菌感染性毛囊炎：可使用抗细菌药物，外用有莫匹罗星、夫西地酸、复方多粘菌素、克林霉素等，内服有头孢呋辛、头孢氨苄、多西环素等。

毛囊炎通常治疗反应好，预后不留瘢痕，在遵照医师指导使用药物的前提下，注意勤洗手、勤换衣物尤其是贴身衣物、勤洗毛巾、减少衣物摩擦皮肤等，因为也是注意清淡饮食，避免进食辛辣刺激发物，保持心情舒畅。