女性患者患有沙眼衣原体应该积极使用抗生素治疗。沙眼衣原体是常见的病原体，主要会感染人类的粘膜组织，例如眼部的结膜组织或者泌尿生殖道粘膜等，可以使用盐酸左氧氟沙星，利福平，磺胺醋酰钠等药物进行治疗。

平时应该注意通过切断传播途径来预防沙眼衣原体感染，例如不要用脏手揉搓眼睛，不要用不干净的水源洗脸与洗澡，勤换洗衣物等。