巧克力囊肿穿刺手术是需要麻醉的。巧克力囊肿常见于妇科疾病，一般以卵巢巧克力囊肿最常见，属于盆腔内疾病。麻醉常采用半身麻醉(硬膜外麻醉或蛛网膜下腔麻醉)或全身麻醉。目前常采用腹腔镜下行巧克力囊肿穿刺手术，手术创伤小，术后恢复快。配合此类手术常选用气管插管全身麻醉，一般经静脉注入全麻药，手术中患者无意识，无疼痛，一直处于深度睡眠状态，等待手术结束后再让患者逐渐的苏醒，不会遗留后遗症。

患者回病房后注意休息，第二天可下床活动，防止盆腔黏连。饮食以清淡食物为主，避免油腻及辛辣刺激食物。