牙齿根部出现小肉芽，通常是牙龈炎、牙周炎等口腔疾病的征兆。针对这一现象，患者应及时就医，根据具体病因进行对症治疗，如药物治疗、口腔卫生改善及必要时的手术处理。

1、牙龈炎或牙周炎

长期口腔卫生不佳可导致牙菌斑侵蚀牙龈，引发牙龈炎或牙周炎，进而形成肉芽。此时，患者应遵医嘱服用阿莫西林胶囊、甲硝唑片或罗红霉素胶囊等抗菌药物，同时加强口腔卫生，定期刷牙、漱口。

2、牙龈增生

牙龈组织受到局部刺激或激素水平变化影响，可能发生增生，形成肉芽。治疗上，除了口服甲硝唑片、头孢呋辛酯片等抗炎药物外，还需去除刺激因素，如调整不良修复体、改善咬合关系等。

3、根尖周炎

牙髓炎未经及时治疗可引发根尖周炎，导致根尖部牙龈形成肉芽肿。这种情况下，除了药物治疗外，患者还可能需要接受根管治疗，以彻底清除感染源。

4、局部创伤

根尖部受到外力撞击或咬合创伤也可能引发肉芽组织形成。治疗时应首先处理创伤，如调磨牙齿、修复缺损等，并辅以药物治疗促进愈合。

5、其他因素

如牙龈息肉、智齿冠周炎等也可能导致牙齿根部出现肉芽。针对这些病因，治疗方法包括手术切除息肉、智齿拔除等。

综上所述，牙齿根部出现小肉芽时，患者应尽早就医诊断并接受专业治疗，以维护口腔健康。