生殖器上长小肉粒可能由多种原因引起，包括生殖器湿疹、毛囊炎、珍珠状阴茎丘疹等。针对这些不同的病因，治疗方法也各异，下面将简要介绍几种常见的治疗手段。

对于由湿疹引起的小肉粒，治疗的关键在于控制炎症和缓解症状。患者可以在医生指导下使用他克莫司软膏或吡美莫司乳膏等外用药物，这些药物能够有效减轻局部炎症。若瘙痒症状明显，还可以考虑使用盐酸西替利嗪等抗组胺药物进行缓解。

对于毛囊炎导致的小肉粒，治疗时需要根据感染病原体的不同选择合适的药物。如果是细菌感染，可以使用莫匹罗星软膏或夫西地酸乳膏等抗菌药物；若为真菌感染，则应选用硝酸益康唑乳膏等抗真菌药物。保持局部清洁干燥也是预防和治疗毛囊炎的重要措施。

珍珠状阴茎丘疹通常无需特殊治疗，这是一种良性病变，不会对身体健康造成影响。患者只需注意个人卫生，定期清洁即可。若感到局部不适，可以涂抹一些具有舒缓作用的外用药膏。

此外，对于其他病因引起的小肉粒，如尖锐湿疣等，治疗方法则可能包括激光治疗、冷冻治疗或电灼术等物理手段，以及使用咪喹莫特乳膏等外用药物。

总之，生殖器上长小肉粒的治疗需根据具体病因进行。患者在发现症状后，应及时就医，由专业医生进行诊断和治疗。同时，保持良好的生活习惯和个人卫生，增强自身免疫力，也是预防此类疾病的重要措施。在治疗过程中，患者应遵医嘱用药，切勿自行盲目使用或更改药物。