阿莫西林和氨苄西林都属于氨基青霉素，两者的结构是有所区别的，阿莫西林是在氨苄西林的结构基础上多加了一个羟基，所以结构更稳定一些，而且不容易被碱性环境破坏，两者都属于广谱的抗生素。阿莫西林主要就是可以用于一些细菌引起的上呼吸道感染或者泌尿系统的感染，皮肤的感染，下呼吸道的感染，还可以用于急性单纯性淋病，以及幽门螺杆菌的感染，常见的副作用就是会有一些胃肠道的反应，还可能会引起过敏的反应，比如会引起皮疹，药物热等。

氨苄西林胶囊可以用于敏感的细菌引起的呼吸道的感染或者是消化道感染，泌尿道的感染，还有脑膜炎，心内膜炎等。不良反应是与阿莫西林相似的，最常见的就是会有一定的胃肠道的反应，比如会引起恶心，呕吐或者是腹泻，另外在用药过程中也会引起过敏的反应，尤其会引起皮疹，瘙痒等。两个药物在用药前都是需要做青霉素皮试实验的，如果青霉素皮试试验阳性的患者，是要禁止使用药物的。