新生儿做核磁共振比较常检查的部位有中枢神经系统，这是第一个比较常见的，做头颅或者颈椎，看颅内脑组织发育情况，以及排除有没有出血，有没有损伤等等，因为有一些新生儿而在生产当中可能有一些异常情况，比如说用牵引器，比如说有一些意外的摔伤等等。

其次可以检查新生儿的脊柱，看脊柱有没有发育完全，有没有先天性的畸形，有没有脊柱裂，有没有这种脊髓脊膜膨出等。

另外，第三个比较常用的检查四肢，四肢的一些发育畸形，看里面的骨质情况，因为新生儿骨头还比较软些，核磁共振检查效果也是比较好的，而且核磁共振相对于CT来说它是没有辐射的，对新生儿的发育，将来的身体生长，这都是没有不利影响的，所以说都是可以做的，当然一般来说新生儿很少有做CT的辐射，因为CT的辐射相对于新生儿来说可能要稍微大一些，基本上能做磁共振首选是做磁共振检查。