生殖器疱疹在潜伏期同样是具有传染性的。生殖器疱疹是由单纯疱疹病毒感染而引起的性传播性疾病，其潜伏期往往是2至7天，在潜伏期时是不会产生相应的临床症状。而在潜伏期过后往往会在生殖器部位出现集簇性水疱，脓疱伴有糜烂或浅溃疡的，有时可触及到局部腹股沟淋巴结肿大和发热，这时往往是需要通过抗病毒药物来治疗的。

在患者的抵抗力正常时，体内单纯疱疹病毒往往是潜伏于神经根处，而处于冬眠的状态。一旦患者的抵抗力下降，如发热，感冒，手术时往往会使体内病毒大量的复制，从而产生相应的临床症状的。