JC病毒的危害是当人体免疫功能不全或接受免疫抑制治疗的患者中可引起进行性多灶性白质脑病等致死性中枢神经系统脱髓鞘疾病，表现为快速进展性痴呆、失语、发音困难、性格改变、智力下降、精神错乱、幻觉甚至昏迷等，一般数月内死亡。

JC病毒初次感染一般发生在儿童时期，并且多无临床症状，JC病毒可通过分娩（胎盘）、哺乳或长期共同生活接触从母亲传播给子女，也可通过呼吸道、消化道传播。

JC病毒又称JCV，JCV感染是世界范围的，根据全世界不同地区的统计，成人的JCV感染率是50%到90%。原发感染后可致病毒血症，病毒到达肾脏潜伏下来，在机体免疫下降或妊娠期间，病毒可重新激活并复制，可以通过尿排出体外，污染周围环境，以气溶胶的方式通过呼吸道感染。