第三针五天以后可以做核酸。

新冠疫苗第3针作用比较大，在接种新型冠状病毒疫苗的前两针以后，虽然机体会产生一定的抗体，但是随着时间的推移，体内的抗体水平可能会有所下降。因此在接种新型冠状病毒疫苗第3针以后，有利于刺激机体再一次对新冠疫苗病毒产生抗体，有助于预防新型冠状病毒感染，从而减少对身体的伤害。

在打完第3针新冠疫苗5天以后可以做核酸检测，一般不会影响到药物的效果。而做核酸检测是查找患者的呼吸道标本、血液或粪便中是否存在外来入侵的病毒的核酸，来确定是否被新冠病毒感染。所以在打完第3针新冠疫苗五天以后，可以做核酸检测。通过检查以后，如果发现是阴性，就说明没有感染新型冠状病毒。但如果检查后发现是阳性，就证明患者体内有病毒的存在，需要及时的进行隔离治疗。