经期打了第三针新冠疫苗通常不会产生后遗症，因为目前并没有资料显示经期打第三针新冠疫苗存在明确后遗症，但少部分人群可能会产生不同程度的副作用。

由于女性在经期身体免疫能力比较低下，在打完第三针新冠疫苗之后可能会产生不同程度副作用，比如造成接种部位出现红肿，瘙痒，疼痛，硬结等现象，可以通过做局部热敷来改善。

还有部分人群在打完第三针新冠疫苗之后，可能会产生恶心，呕吐，腹泻，头痛发热等症状，尤其是在经期身体通常比较虚弱，可能会加重以上不良反应，所以一般不建议在经期打第三针新冠疫苗，打完第三针新冠疫苗之后要注意适当休息，避免使身体过度劳累，同时要做好针眼处的保护工作。

在日常生活中注意做好个人防护措施，严格戴口罩，避免去人员密集的场所。