早上起床呼吸不畅过一会就好了首先考虑是生理性因素引起的，也有可能是病理性因素导致的，比如支气管炎、冠状动脉粥样硬化性心脏病等，可以通过口服药物以及手术治疗。

1、生理性因素：如果室内空气质量不好，会导致人体出现缺氧的情况，出现早上起床呼吸不畅过一会就好了，此时需要开窗通风，多呼吸一些新鲜的空气，一般不需要特殊治疗。

2、病理性因素：

支气管炎：支气管炎通常是由于微生物感染引起的，或者是化学以及物理刺激造成的，主要表现为咳嗽以及咳痰等，同时还有可能会造成早上起床呼吸不畅过一会就好了，可以服用盐酸氨溴索口服溶液、氢溴酸右美沙芬片等药物治疗。

冠状动脉粥样硬化性心脏病：冠状动脉粥样硬化性心脏病可能是冠状动脉管腔狭窄以及闭塞造成的，典型症状为胸闷气短、胸痛以及呼吸困难等，甚至会造成早上起床呼吸不畅过一会就好了，可以服用酒石酸美托洛尔片、阿司匹林肠溶片等药物治疗，必要时需要通过冠状旁路移植术治疗。