自闭症儿童不能吃麸质或酪蛋白食物、特殊碳水化合物，如面粉、小麦、酸奶、酸乳酪等。

1、麸质或酪蛋白饮食：自闭症儿童常伴有食物不耐受或过敏，需要去除食谱中可能引起食物不耐受和过敏的食物人们发现减少或杜绝含有谷蛋白和酪蛋白的食物能够减轻自闭症症状。从食物中去除面粉、小麦、大麦、燕麦可能含有谷蛋白的食物，并且杜绝所有奶和奶制品，包括牛奶、酸奶、奶酪以及奶昔等可能含有酪蛋白的食物。

2、特殊碳水化合物饮食：目的是缓解患儿的吸收障碍症状并防止致病性肠道微生物的增长。不仅完全无麸质，也无淀粉。此类饮食严格限制了所有的淀粉和多糖类，绝大部分的酵母菌以及其他有害肠道病原体得以抑制，进而保护肠道微生态系统，减少肠道感染，恢复肠道健康。同时也建议摄入单糖、酸奶、酸乳酪或益生菌等，促进肠道中有益微生物的生长，有助于消化功能的恢复，改善行为、感知和语言发展。

适当的饮食能够帮助患儿减轻痛苦，改善胃肠道症状。