晚上睡觉时耳朵出现咚咚咚的响声，这种情况在医学上通常被称为耳鸣。耳鸣可能是由多种原因引起的，主要包括神经性耳鸣、分泌性中耳炎以及血管搏动性耳鸣等。

神经性耳鸣往往与患者的精神状态有关，如过度劳累、精神紧张等都可能诱发。此类耳鸣通常伴随耳部疼痛、头晕等症状，治疗时可以考虑使用营养神经的药物，如甲钴胺片、维生素B1片等。

分泌性中耳炎则多与上呼吸道感染或气压损伤有关，表现为耳内流液、刺痛等。治疗时除了可以使用罗红霉素片、阿奇霉素片等进行抗感染治疗外，还需注意保持耳部清洁。

血管搏动性耳鸣则是由于血管异常改变或血流紊乱引起的，其响声与心跳节奏一致。针对这类耳鸣，可能需要进行更详细的血管检查，并根据具体情况选择药物治疗或手术治疗。

除了上述原因，耳鸣还可能与耵聍栓塞、鼓膜内陷等因素有关。因此，当出现晚上睡觉耳朵咚咚咚响的情况时，建议患者及时前往医院进行检查，以便准确诊断并接受针对性治疗。