咽炎跟扁桃体有直接的关系，因为咽喉与扁桃体处在一个位置上，所以患了咽炎后，很容易引起扁桃体发炎，所以在临床上有时出现嗓子痛时，如果不进行检查很难分辨出是咽炎导致的还是扁桃体炎导致的，只有通过专科医生检查才能确诊到底是咽炎还是扁桃体炎导致的。

在临床上咽炎和扁桃体炎的治疗用药基本相同，急性期可以采用口服抗生素或静脉滴注，慢性咽炎、扁桃体炎可以采用中成药配合口服抗生素治疗，具体的用药应以面诊医生为准。