临床上并没有喉咙有脓肿怎么治疗最好的说法，喉咙有脓肿有可能是因为咽部损伤、扁桃体炎、急性咽炎等原因导致的，可以通过一般治疗、药物治疗等方式进行改善。

1、咽部损伤：

如果在吃东西时，不小心将鱼刺、骨头等咽下去，就有可能会划伤喉咙，如果没有仔细护理，就有可能会导致患者出现这种情况。此时应当加强护理，保持口腔清洁，清淡饮食，能够有利于病情恢复。

2、扁桃体炎：

是一种常见的上呼吸道感染性疾病，多是由于微生物感染、免疫力下降等引起的。出现此种情况可以在医生的指导下服用阿莫西林胶囊、头孢克肟胶囊、罗红霉素胶囊等药物进行治疗。

3、急性咽炎：

是咽部粘膜、粘膜下组织以及淋巴组织的急性炎症，也有可能会引起上述症状。患者可以在医生的指导下服用银黄含片、六神丸、蒲地蓝消炎口服液等药物进行治疗。

除此之外，还有可能是因为咽喉脓肿等疾病引起的，无论哪种原因，都应当积极的配合医生进行治疗，以免延误病情.