拔牙后三天出现耳朵内部疼痛，可能并非单一原因所致，而是由多种医学情况引起的综合反应。常见的原因包括放射性疼痛、外耳道炎、中耳炎等。

1、放射性疼痛

是拔牙后常见的现象。由于拔牙过程中可能对周围神经造成刺激，这种刺激有时会放射至耳朵区域，导致耳内疼痛。通常，这种疼痛会随着时间推移逐渐减轻。

2、外耳道炎

也是可能的原因之一。拔牙后，如果外耳道受到细菌侵袭或损伤，就可能引发炎症，表现为耳朵疼痛、肿胀等症状。

3、中耳炎

同样不容忽视。拔牙后若护理不当，口腔内的细菌可能通过咽鼓管进入中耳，从而引发中耳炎，造成耳痛、听力下降等问题。

针对这些疼痛情况，治疗时可能会考虑使用诸如阿莫西林、罗红霉素等抗生素药物来控制感染，或者采用局部冷敷的方法来缓解疼痛。然而，具体药物的选择和使用必须根据医生的诊断和指导来进行，患者不应自行购药使用。