牙齿有黑色污垢可能是因为色素沉着、牙结石伴有色素沉着或龋齿等原因造成的。

色素沉着可能是因为日常生活中摄入过多含有色素的饮食或者使用含有色素的口腔用品，如：经常喝咖啡、喝茶、吸烟等等。去除色素沉着的黑色污垢可以考虑选择全面口腔清洁，例如洁治，喷砂抛光，一般可以将牙齿上堆积的色素进行彻底的去除，色素去除后，黑垢自然而然的也就消失了。在日常生活中，注意尽量少吃有色素的食物和饮料等。

如果是牙结石伴有色素造成的，需要去除牙结石，黑垢也会随之消失，常用的去除牙结石的方法为超声波洁牙，也就是常说的洗牙，洗牙后要注意认真刷牙、维持好口腔卫生。

另外，龋齿也可能造成牙齿有黑色污垢，龋齿会破坏牙齿组织，使牙齿产生龋洞，针对龋洞，需要积极就医进行充填治疗，如复合树脂充填术或玻璃离子充填术等。