对于绝大多数的肠套叠患者，并没有一个绝对的预防措施，因为多数的肠套叠是原发性肠套叠，这时发生套叠的肠段以及临近的部分，是找不到明显的器质性因素的。

如果要预防可以采取以下几个措施，主要是在患儿进食饮食的时候，要注意不要突然的更改饮食习惯，避免肠道活动加剧，而诱发肠道叠。另外，在呼吸道感染好发的季节，尤其是在春季，要注意进行呼吸道感染的预防，如果出现了呼吸道感染，要及时进行治疗。

如果曾经发生过肠道叠以后，又反复发生肠套叠患者，要进行进一步的检查，因为复发性的肠道叠，常常提示存在肠道的器质性病变，比如存在肠道息肉或者肿瘤，以及腹部紫癜等，这是可以进行进一步的检查，比如可以进行肠镜检查，排除是否存在肠道息肉。