新生儿先天性心脏病是引起新生儿青紫的重要原因，新生儿出现严重青紫应该详细检查有无先天心脏病。许多青紫型先天性心脏病，在新生儿期即有表现，如完全性大动脉转位，肺动脉闭锁，三尖瓣闭锁，完全性肺静脉异位引流，左心发育不良综合征等。应该注意某些青紫型先心病在新生儿期可不表现青紫，如法洛四联症，在新生儿期因动脉导管开放，进入肺循环内血液明显的减少，青紫可不出现。永存动脉干因新生儿期肺内小动脉尚未硬化，肺循环压力较低，可有大量血液进入肺内，青紫很轻或者是无明显的青紫。

相反，某些非青紫型心脏病在新生儿期有时可出现青紫，如室间隔缺损，当某些因素使肺动脉压力增高超过主动脉压时使右心压力大于左心压力，经过缺损的口又向左分流产生青紫。青紫型心脏病大多伴有心脏杂音，是重要的诊断依据，但是也并不是完全绝对的。完全性大动脉转位和肺动脉伴闭锁，如不合并其他心脏的畸形，均听不到杂音或者是无响亮的杂音。因此当新生儿有中心性青紫的时候，尤其是当青紫伴有心界扩大和心力衰竭时，不论是否有心脏杂音都应该做心脏超声检查，确定有无先天性心脏病。