一般无法自愈，但是骶管囊肿比较常见，大多数无症状。对于无症状的患者一般不需要处理，可先行观察。对于有症状者，应除外椎间盘突出、椎管狭窄或者是骶管内肿瘤的前提下，积极手术治疗。

一般来说出现下列情形可以手术治疗，腰腿痛和间歇性跛行，保守治疗无效，影响正常生活和工作，腰腿痛伴下肢肌力感觉减退，会阴部疼痛或感觉减退，大小便和性功能障碍。

手术应在显微镜下操作，将囊肿修剪成型，用剪刀锐性切除囊肿壁，不应钝性剥离，避免神经根损伤，不要强求完整切除囊壁。手术应找到囊积液漏口，用血管吻合线进行关闭。

术后患者应尽量采取头低臀高卧位，伤口用沙袋加压，下地活动应该一周以后，避免出现脑脊液漏的情况。这一系列的囊肿发生原因可能是起源于脊髓被膜，故因胸椎管内膜囊肿来总称这类疾病。

椎管内囊肿多数认为是先天性，也有部分是后天获得，各行的成因有所不同，囊肿形成的，总是由于初期与蛛网膜下腔相通，脑积液随着动脉搏动进入，最终由于流出不畅或液体静脉增加而形成。