目前临床上诊断肠结核时，主要是依据病人的症状以及体征，比如会引起腹痛、大便变化、腹泻、便秘、右下腹部包块等症状，结合病理学检查来确诊，比如肠镜检查、结核菌素试验等。

在确诊肠结核之后，患者需要严格遵医嘱使用抗结核药物进行治疗，如果符合手术指征，比如造成肠梗阻或肠穿孔时，要及时选择手术治疗。