肾结石手术未取净并不意味着治疗失败，而是需要根据具体情况调整治疗方案。患者应积极配合医生的治疗建议，并遵医嘱用药，如有任何不适，应立即就医。

当残留结石小于1厘米时，通常会选择体外冲击波碎石术。这种方法通过体外冲击波将残余结石击碎，随后辅助使用排石药物帮助碎石排出体外。治疗过程大约需要2至3次辅助碎石。

若残留结石较大，例如超过2厘米，医生可能会考虑进行二期清石手术。手术方法包括输尿管软镜钬激光碎石或经皮肾镜钬激光碎石等，这类手术通常在首次手术后至少两周，待患者身体恢复后进行。

对于小于6毫米的残留结石，一般建议口服排石药物进行治疗，如上述的尿石通丸等，这种情况下通常不考虑手术或体外冲击波碎石。

在治疗过程中，医生会密切关注患者是否出现出血、感染等症状，并及时采取相应的治疗措施。患者在日常生活中也应注意增加水分摄入，适量食用新鲜蔬果，这有助于预防结石的再次形成。