肛瘘手术的痛苦程度在临床上并无明确排名，其疼痛感受受多种因素影响，不可一概而论。

手术方式的不同会导致疼痛程度有所差异。例如，挂线疗法因术后橡皮筋的切割作用，往往疼痛较为剧烈，而直接切开瘘管的疗法则相对疼痛较轻。

患者的自身体质也是影响疼痛感受的重要因素。体质较好、对疼痛耐受力强的患者，术后感受到的疼痛往往较轻。相反，体质较弱或对疼痛敏感的患者，则可能感受到更明显的疼痛。

术后护理的质量同样不容忽视。如果术后能够做到彻底的清洁、及时的换药以及正确的坐浴，那么因分泌物刺激引起的疼痛不适就会大大减少。

为了缓解肛瘘手术后的疼痛，医生会推荐使用一些药物，如布洛芬、对乙酰氨基酚等止痛药。这些药物能够在一定程度上减轻患者的疼痛感受，帮助患者更好地度过术后恢复期，但是要遵医嘱来选择和应用。

总的来说，肛瘘手术的痛苦程度因人而异，受手术方式、患者体质及术后护理等多重因素影响。患者在面对手术时，应保持积极心态，遵医嘱进行科学护理和用药，以期早日恢复健康。如有任何不适或疑虑，应及时就医咨询。