肛门消毒是维护肛肠健康的重要环节，但“最好”的药物并不存在，而是应根据具体病情选择合适的药物。一般而言，高锰酸钾溶液、抗生素药膏和马应龙麝香痔疮膏是常用的选项。

高锰酸钾溶液因其强氧化性，能有效缓解由细菌感染引起的肛门瘙痒。它通过与皮肤黏膜的蛋白质结合，形成保护层，从而减轻症状。但需注意，高锰酸钾的使用应在医生指导下进行，避免浓度过高造成皮肤损伤。

抗生素药膏则适用于肛门及周围皮肤的红肿、发热等细菌感染症状。常见的红霉素软膏、盐酸克林霉素凝胶等，能有效控制感染，促进炎症消退。

对于痔疮患者，马应龙麝香痔疮膏是常用的选择。它能有效缓解便血、肛裂等症状，具有消肿、止血和防腐作用。但需注意，此药为外用药，不可内服。

除了药物治疗，正确的肛门清洁方法同样重要。使用温水和柔软的清洁工具，避免过度清洁造成的干燥和不适。同时，保持良好的生活习惯，如均衡饮食、适量运动，也是预防肛门疾病的关键。

总之，肛门消毒用药需根据病情选择，合理使用药物，并结合良好的生活习惯，共同维护肛肠健康。如有任何不适，应及时就医，遵医嘱进行科学治疗。