妇科肛门B超一般不会引起明显的疼痛，但可能会有轻微的不适感。

在进行妇科肛门B超时，医生会将超声探头插入肛门进行检查。由于肛门部位较为敏感，初次接受此类检查的患者可能会感到一定的紧张和不适。然而，这种不适感通常是暂时的，并且可以通过放松身体和配合医生的指导来减轻。一般来说，肛门B超的检查过程较为迅速，医生也会尽量确保操作的轻柔和准确，以减少患者的不适。

需要注意的是，虽然肛门B超本身不会引起疼痛，但如果患者存在肛门疾病或感染等情况，可能会在检查过程中感到额外的不适。因此，在接受肛门B超前，患者应如实告知医生自己的健康状况，以便医生做出相应的调整和处理。

总之，妇科肛门B超一般不会引起疼痛，但可能会有轻微的不适感。患者在接受检查时应保持放松，配合医生的指导，以确保检查的顺利进行。