肛瘘手术后的伤口愈合大致可以分为三个阶段，坏死脱落期、肉芽生长期和皮肤愈合期。

肛瘘手术后在坏死脱落期，由于手术中使用医疗器械，可能会造成切口局部的热损伤。术后一周内，这些损伤的组织会逐渐坏死并脱落，这是正常的愈合过程的开始。接下来进入肉芽生长期，通常在术后的第二周开始。此时切口内部开始快速生长出新鲜的肉芽组织，这些肉芽会逐渐填满整个切口，为伤口的最终愈合打下基础。最后一个阶段是皮肤愈合期。当肉芽组织填满切口后，肛门周围的皮肤开始愈合，标志着整个伤口愈合过程的完成。这个阶段需要特别注意伤口的清洁和保护，以避免感染。

在整个愈合过程中，患者应保持伤口的清洁卫生，定期换药，并避免剧烈运动以防止伤口裂开。合理饮食，多摄入富含蛋白质和维生素的食物，也有助于伤口的愈合。若出现任何异常情况，如伤口红肿、疼痛加剧等，应立即就医。