深呼吸时感到肾区疼痛，可能是肾脏或周边组织出现问题的信号。常见原因包括腰肌劳损、肾盂肾炎和肾结石。

腰肌劳损时，深呼吸会牵拉受损的肌肉，引发疼痛。肾盂肾炎则是细菌感染导致，深呼吸可能加重炎症刺激，使疼痛感更明显。肾结石患者在深呼吸时，肾脏与结石的摩擦也可能导致疼痛。

治疗方面，针对腰肌劳损，可考虑双氯芬酸钠缓释片等药物缓解疼痛；肾盂肾炎患者可根据医嘱使用磺胺嘧啶片等抗生素治疗；而肾结石则可能需要硫酸阿托品片等药物，或采取手术治疗。

此外，肾盂积水、肾炎和腰椎间盘突出症也可能导致深呼吸时肾区疼痛。这些情况都需要及时就医，准确诊断后在专业医生的指导下进行针对性的治疗。具体药品使用请在专业医生指导下用药。